選擇氣相色譜儀需要考慮的影響因素：

一、柱徑和柱長：內徑較小的柱管和較大的柱形曲率半徑，可獲得較高的柱效。由此可看出毛細管柱比填充柱柱效高，直型和U型管比盤型管柱效高，增長柱子長度，可提高柱效，但考慮分析時間、壓力等因素，柱子不宜過長，一般為1-2米。

二、載體密度:不同種類載體之間密度差別很大，可是同一類型的載體密度也不很一致。如果填料中固定液濃度相同，但載體密度不同，那么同一組分在兩顆柱子中保留值也不可能一樣。

三、載氣種類:氣相色譜中常用的是氮、氫、氦、氬等幾種載氣，組分在氣相中擴散系數與載氣分子量或密度平方根之倒數成正比。通過實驗證明：熱導檢測器常用氫、氦、氮作載氣，氫火焰和火焰光度檢測器常用氮、氫作載氣可獲得較高柱效。

四、載氣流速:要獲得理想的柱效率，須有較為合適的流速。

五、工作溫度設定：

 1）柱子溫度：提高柱溫，有利于減小固定液粘度和載氣粘度，加快傳質過程，有利于加快分析速度，但柱溫不宜過高；過高會使固定液流失嚴重，儀器也難以穩定，給操作帶來不便，因此一般宜選用較低柱溫。

2）氣化和檢測器溫度：氣相色譜法中，一般是使樣品以氣態狀態進入柱中分離，而液體和固體樣品均需氣化，氣化溫度與樣品的性質和進樣量等因素有關，在氣相色譜分析進樣量很少以微克計量，是一個很稀的氣態溶液體系，所以氣化溫度往往只比柱溫高10-50℃即可使樣品瞬間氣化。

3）檢測器溫度一般與氣化溫度接近即可，若是程序升溫則把檢測器溫度控制在接近高柱溫即可，但是須知，氫火焰和火焰光度檢測器溫度應高于100℃以免積水，污染檢測器，檢測器一般對溫度變化很敏感。

六、進樣技術

1 進樣量：應控制在瞬間氣化達到規定分離要求。一般固體或液體為0.01-10微升，氣體為0.1-10毫升。

2 進樣時間：進樣時間長短對柱效影響很大，進樣時間過長會使色譜區域加寬而降低柱效，一般越短越好，必須小于1秒鐘

3 進樣設備：氣態進樣選擇六通閥，液態進樣選擇器。